Moona Boone – 3.01 (diffusé le 20.09.05)
Christian a été assassiné par le Découpeur. Tous ses proches se retrouvent à son enterrement. Lorsque Sean prononce l'éloge du défunt, on comprend alors que ce n’était qu’un cauchemar de Christian. En réalité, Troy n'a été que blessé par le tueur en série. Mais les blessures sont suffisamment profondes pour atteindre son moral. Il ne peut plus pratiquer. Sean lui cherche un remplaçant. Dans le même temps, il doit procéder à une intervention peu banale : séparer chirurgicalement une femme obèse du lit sur lequel elle était allongée depuis des années.

Kiki – 3.02 (diffusé le 27.09.05)
Christian opère une femelle gorille , la vie sexuelle de Matt prend un sombre tournant après avoir découvert qu’Ava était un transsexuel, Quentin et Sean s’opposent a Christian a propos de l’opération d’un membre d’un gang, ce dernier est venu se faire enlever ses tatouages afin de se racheter une conduite.

Alex, Derek and Gary – 3.03 (diffusé le 04.10.05)
Sean, Julia et Christian ne savent plus quoi faire pour gérer les crises de Matt, devenu incontrôlable. Quentin et Sean s'occupent de trois étudiants dont le bizutage a particulièrement mal tourné. Quant à Christian, il finit par se lasser de son ménage à trois avec Kimber et Kit. Il tente de convaincre Quentin de sortir avec Kit.

Rhea Reynolds – 3.04 (diffusé le 11.10.05)
Une femme d'âge mûr demande à Sean et Christian de l'aider à retrouver ses vingt ans. Elle souhaite ainsi stimuler la mémoire de son mari, dont la mémoire est rongée par la maladie d'Alzheimer. Pendant ce temps, une nouvelle victime du découpeur arrive au cabinet.

Granville Trapp – 3.05 (diffusé le 18.10.05)
Rhea Reynolds est retrouvée morte. Elle a été victime du Découpeur, mais c'est Christian devient le principal suspect. N'a-t-il pas manifesté ouvertement de la méchanceté envers la pauvre femme ? Pendant ce temps, Sean s'occupe d'un homme au teint très pâle, en raison de la thérapie très lourde qu'il suit pour lutter contre le sida.

Frankenlauren – 3.06 (diffusé le 25.10.05)
Sean et Christian visitent une morgue. Là bas, ils découvrent que l'un des employés de l'établissement a créé une femme à partir de morceaux de cadavres empruntés à d'autres femmes. Au cabinet, les deux chirurgiens opèrent une patiente allemande. Pendant ce temps, Julia rencontre Gina...

Ben White – 3.07 (diffusé le 01.11.05)
Sean cherche un sens à sa vie. Il devient le chirurgien attitré du programme de protection des témoins. Christian reçoit un homme qui le supplie de l'amputer de sa jambe, qui est pourtant parfaitement valide. Julia, Gina et Liz font équipe et décide de lancer un nouveau produit de beauté à base de sperme...

Tommy Bolton – 3.08 (diffusé le 08.11.05)
Sean semble éprouvé des sentiments envers Nicole Morretti, Quentin lui se rapproche de Julia. Pendant ce temps, à la clinique, Troy reçoit un patient qui souffre de ne pas ressembler aux autres membres de sa famille. La mère biologique de Christian décide de refaire surface...

Hannah Tedesco – 3.09 (diffusé le 15.11.05)
Christian et Quentin se disputent au sujet d'une opération à risque. Tandis que l'un pense aux implications éthiques de l'affaire, l'autre pense plutôt à la réputation du cabinet. Du coté de Sean, ce dernier se demande s'il ne devrait pas profiter de son nouvel emploi de protection des témoins pour disparaître.

Madison Berg – 3.10 (diffusé le 22.11.05)
Christian se pose des questions sur son avenir avec Kimber. Gina tente de convaincre celle-ci de le laisser tomber pour de bon. Matt, lui s'est trouvé une nouvelle petite amie, qui n'apprécie pas le travail de Sean et Christian, en effet la jeune femme compare la chirurgie esthétique aux horreurs du nazisme.

Abby Reese – 3.11 (diffusé le 29.11.05)
Sean découvre par hasard que Quentin et Julia ont un rendez-vous, il se sent alors profondément trahi. Pour lui, il n'y a qu'une seul solution à envisager : Quentin doit impérativement quitter le cabinet. Du côté de Christian, lui semble prendre tout à fait sereinement le départ de Kimber. Mais son comportement indique qu'il ne va pas si bien que cela. Ses proches s'en inquiètent...

Sal Perri – 3.12 (diffusé le 06.12.05)
Une fois de plus, Julia a une terrible dispute avec sa mère. Peu après Julia apprend que l'avion où elle se trouve s'est écrasé. Elle se rend alors sur place. Il y a bien des survivants, mais aucun nom n'est pour l'heure dévoilé. Dépitée, elle appelle Sean...

Joy Kringle – 3.13 (diffusé le 13.12.05)
Le père Noël se rend avec sa femme à une consultation à la clinique. Soucieuse de donner une image qui respire la santé, celle-ci veut subir une liposuccion... Pensant qu'elle couve quelque chose, Julia demande à Sean de lui administrer un vaccin. Prudent, le médecin tient à faire une analyse de sang pour s'assurer que tout va bien.

Cherry Peck – 3.14 (diffusé le 20.12.05)
Cherry Peck, le travesti que Matt avait tabassé, demande à Sean et Christian de réparer les dégats... Christian reçoit au cabinet un mystérieux colis qui perd du sang. A l'intérieur, il y trouve une paire de prothèses mammaires... Sean prévient Julia qu'il lui faut passer des examens pour s'assurer que tout ira bien pour le bébé.

Quentin Costa – 3.15 (diffusé le 20.12.05)
Le Découpeur a encore frappé ! Mais cette fois, il a fait 9 victimes. Grâce au témoignage de l'une d'elles, Kit obtient une preuve suffisante pour arrêter Quentin Costa, la police débarque aussitôt chez le chirurgien où une surprise les attend. Ariel et son père tendent un piège à Matt... Sean a pris des dispositions pour laisser la maison à Julia.